Hệ thống lọc trong bể cá có rất nhiều loại và cách bố trí của mỗi loại lọc cũng khác nhau, chỉ khi bố trí hợp lý thì mới phát huy hết công năng lọc nước. Đếm từ đáy, lớp thứ nhất (lớp dưới cùng) vòng gốm, lớp thứ hai bông sinh hóa, lớp thứ ba của giai đoạn lọc sinh hóa, vòng từ và bóng sinh hóa, lớp thứ tư đá amoniac và than hoạt tính, bơm chìm, lọc trên bông.
Nếu chỉ sử dụng bông lọc thì chiều cao từ đầu nước vào của lõi lọc đến đầu ra nước là 20 cm, các lõi lọc này cộng thêm 10 cm sẽ có tác dụng tốt hơn rất nhiều. Nói cách khác, việc lọc phụ thuộc vào việc lọc bao nhiêu lớp chứ không phải bao nhiêu vật liệu lọc và vật liệu lọc nào.
Phương pháp được sử dụng phổ biến hiện nay là thông qua quá trình lọc vật lý đơn giản, mục đích là phá vỡ các mảnh chất hữu cơ lớn và đẩy nhanh tốc độ phân hủy, sau đó sử dụng hệ thống lọc sinh học mạnh để phân hủy các chất hữu cơ mịn thành nitơ amoniac và dần dần phân hủy sạch. Tỷ lệ sử dụng vật liệu lọc dựa trên 10% không gian dành cho lọc vật lý, 10% không gian dành cho hệ thống ổn định chất lượng nước và 80% không gian còn lại dành cho lọc sinh học.
Muốn bể cá đẹp thì phải đặt cây thủy sinh vào nước, trong cửa hàng cá cảnh có rất nhiều loại cây thủy sinh, bạn có thể lựa chọn theo sở thích của mình. Cây thủy sinh cố định phải cần đá, đá nhỏ không dễ vệ sinh có thể dùng đá hoa mưa to ép vào gốc cỏ nước, khi vệ sinh chỉ cần lấy đá hoa mưa ra rửa sạch là được.
Bạn có thể đặt một số non bộ, hoặc đá thật, hoặc san hô vào bể cá, để có thể xây dựng nó thành một thế giới dưới nước rất chân thực. Mặt sau của bể cá có thể được dán bằng giấy dán tường, loại giấy dán tường này có bán ở cửa hàng cá cảnh. Trong quá trình cho cá ăn, các chất cặn bã và cá sẽ bị phân hủy sau khi cho ăn sinh ra rất nhiều chất độc hại.
Vì vậy, cần có thiết bị lọc phù hợp, các vi khuẩn có lợi được nuôi cấy trong thiết bị lọc có thể phân hủy một lượng lớn các chất độc hại, làm cho cá phát triển khỏe mạnh, giữ cho vùng nước luôn trong sạch. Vật liệu lọc được làm sạch nửa tháng một lần Không sử dụng chất tẩy rửa hoặc các chất tương tự khi vệ sinh, cũng như không cần phải rửa đặc biệt sạch sẽ để vi khuẩn có ích tái sinh.
Nếu không có thiết bị lọc, bạn có thể thay nước thường xuyên để đáp ứng yêu cầu sinh trưởng của cá, tiêu chuẩn thay nước nên thay thường xuyên, mỗi lần thay 1/4 nước và thay nước 3 ngày một lần, ngày thay nước tùy theo độ đục và nhiệt độ của thủy vực. Thay nước mỗi ngày một lần vào mùa hè và 3 ngày một lần vào mùa đông.
Ngày nay, bể cá cảnh có ó rất nhiều hình dạng và chất liệu. Người tiêu dùng có thể lựa chọn các loại bể khác nhau tùy theo thói quen của cá, yêu cầu về môi trường và sở thích cá nhân. Những bể cá như vậy thường chỉ cần được làm sạch kỹ lưỡng sáu tháng một lần. Giặt bông lọc 15 ngày một lần và pha thêm một ít nước mỗi tuần để tạo lượng nước bay hơi và cần rửa đá thường xuyên.